Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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CDH18Q13634 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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CDH18Q13634 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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CDH18Q13634 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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