Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HDAC1Q13547 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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