Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPM6BQ13491 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms