Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
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AP3B2Q13367 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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AP3B2Q13367 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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AP3B2Q13367 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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AP3B2Q13367 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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AP3B2Q13367 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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AP3B2Q13367 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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AP3B2Q13367 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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AP3B2Q13367 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP3B2Q13367 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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