Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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