Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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FOXC1Q12948 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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FOXC1Q12948 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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FOXC1Q12948 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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FOXC1Q12948 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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FOXC1Q12948 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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FOXC1Q12948 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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FOXC1Q12948 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXC1Q12948 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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