Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
STX4Q12846 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
STX4Q12846 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STX4Q12846 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
STX4Q12846 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STX4Q12846 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STX4Q12846 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STX4Q12846 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STX4Q12846 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
STX4Q12846 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
STX4Q12846 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
STX4Q12846 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STX4Q12846 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STX4Q12846 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
STX4Q12846 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
STX4Q12846 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
STX4Q12846 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
STX4Q12846 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STX4Q12846 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STX4Q12846 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STX4Q12846 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STX4Q12846 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
STX4Q12846 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STX4Q12846 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STX4Q12846 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STX4Q12846 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
STX4Q12846 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
STX4Q12846 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STX4Q12846 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
STX4Q12846 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STX4Q12846 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
STX4Q12846 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
STX4Q12846 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STX4Q12846 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
STX4Q12846 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
STX4Q12846 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STX4Q12846 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STX4Q12846 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STX4Q12846 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STX4Q12846 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STX4Q12846 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STX4Q12846 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STX4Q12846 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STX4Q12846 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STX4Q12846 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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STX4Q12846 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STX4Q12846 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STX4Q12846 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STX4Q12846 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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STX4Q12846 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STX4Q12846 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STX4Q12846 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STX4Q12846 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STX4Q12846 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STX4Q12846 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STX4Q12846 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STX4Q12846 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STX4Q12846 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STX4Q12846 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STX4Q12846 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STX4Q12846 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STX4Q12846 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STX4Q12846 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STX4Q12846 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STX4Q12846 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STX4Q12846 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
STX4Q12846 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STX4Q12846 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
STX4Q12846 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STX4Q12846 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
STX4Q12846 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
STX4Q12846 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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