Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms