Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EGR3Q06889 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EGR3Q06889 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EGR3Q06889 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EGR3Q06889 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EGR3Q06889 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EGR3Q06889 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EGR3Q06889 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EGR3Q06889 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EGR3Q06889 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EGR3Q06889 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EGR3Q06889 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EGR3Q06889 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EGR3Q06889 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EGR3Q06889 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EGR3Q06889 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EGR3Q06889 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EGR3Q06889 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EGR3Q06889 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EGR3Q06889 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EGR3Q06889 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EGR3Q06889 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EGR3Q06889 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EGR3Q06889 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
EGR3Q06889 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EGR3Q06889 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EGR3Q06889 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EGR3Q06889 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EGR3Q06889 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EGR3Q06889 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EGR3Q06889 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EGR3Q06889 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EGR3Q06889 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EGR3Q06889 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EGR3Q06889 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EGR3Q06889 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EGR3Q06889 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
EGR3Q06889 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EGR3Q06889 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EGR3Q06889 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EGR3Q06889 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EGR3Q06889 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EGR3Q06889 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EGR3Q06889 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EGR3Q06889 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EGR3Q06889 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
EGR3Q06889 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EGR3Q06889 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EGR3Q06889 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
EGR3Q06889 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EGR3Q06889 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EGR3Q06889 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EGR3Q06889 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EGR3Q06889 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EGR3Q06889 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EGR3Q06889 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EGR3Q06889 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EGR3Q06889 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EGR3Q06889 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EGR3Q06889 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EGR3Q06889 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EGR3Q06889 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EGR3Q06889 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EGR3Q06889 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EGR3Q06889 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EGR3Q06889 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EGR3Q06889 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR3Q06889 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EGR3Q06889 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR3Q06889 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR3Q06889 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EGR3Q06889 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR3Q06889 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR3Q06889 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR3Q06889 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EGR3Q06889 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR3Q06889 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR3Q06889 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR3Q06889 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR3Q06889 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR3Q06889 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EGR3Q06889 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR3Q06889 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EGR3Q06889 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EGR3Q06889 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EGR3Q06889 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EGR3Q06889 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EGR3Q06889 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EGR3Q06889 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR3Q06889 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EGR3Q06889 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EGR3Q06889 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EGR3Q06889 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR3Q06889 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR3Q06889 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EGR3Q06889 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR3Q06889 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR3Q06889 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EGR3Q06889 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EGR3Q06889 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms