Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTBQ06643 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBQ06643 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBQ06643 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBQ06643 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBQ06643 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBQ06643 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBQ06643 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBQ06643 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBQ06643 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBQ06643 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBQ06643 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBQ06643 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBQ06643 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBQ06643 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBQ06643 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBQ06643 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBQ06643 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBQ06643 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBQ06643 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBQ06643 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBQ06643 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBQ06643 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBQ06643 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBQ06643 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBQ06643 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBQ06643 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBQ06643 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBQ06643 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBQ06643 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTBQ06643 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LTBQ06643 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LTBQ06643 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LTBQ06643 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LTBQ06643 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LTBQ06643 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LTBQ06643 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LTBQ06643 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
LTBQ06643 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LTBQ06643 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBQ06643 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBQ06643 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBQ06643 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBQ06643 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBQ06643 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBQ06643 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBQ06643 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBQ06643 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBQ06643 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBQ06643 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBQ06643 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBQ06643 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBQ06643 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBQ06643 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBQ06643 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBQ06643 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBQ06643 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBQ06643 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBQ06643 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBQ06643 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBQ06643 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBQ06643 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBQ06643 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBQ06643 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBQ06643 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBQ06643 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBQ06643 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBQ06643 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBQ06643 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBQ06643 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTBQ06643 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LTBQ06643 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms