Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAD51Q06609 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms