Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPN11Q06124 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms