Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 VN1R11P-201ENST00000407795 868 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC129507.2-201ENST00000572499 748 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC020763.2-201ENST00000623155 1255 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 LLPH-202ENST00000446587 1177 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 SEPHS1P7-201ENST00000452995 1177 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC239868.3-201ENST00000577853 1234 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP2Q05952 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms