Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE3AQ05086 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3AQ05086 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms