Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CENPEQ02224 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms