Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms