Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OTUD4Q01804 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms