Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms