Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms