Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms