Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP1P63208 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP1P63208 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP1P63208 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP1P63208 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP1P63208 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP1P63208 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP1P63208 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP1P63208 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP1P63208 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP1P63208 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP1P63208 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP1P63208 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP1P63208 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP1P63208 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP1P63208 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP1P63208 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP1P63208 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP1P63208 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP1P63208 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP1P63208 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP1P63208 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP1P63208 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP1P63208 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP1P63208 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP1P63208 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP1P63208 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP1P63208 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP1P63208 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP1P63208 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP1P63208 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP1P63208 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP1P63208 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP1P63208 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP1P63208 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKP1P63208 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKP1P63208 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP1P63208 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP1P63208 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP1P63208 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP1P63208 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP1P63208 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP1P63208 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP1P63208 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP1P63208 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP1P63208 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP1P63208 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP1P63208 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP1P63208 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP1P63208 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP1P63208 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP1P63208 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP1P63208 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP1P63208 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP1P63208 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP1P63208 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP1P63208 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKP1P63208 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms