Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SNRPNP63162 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPNP63162 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms