Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63132 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms