Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARF3P61204 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARF3P61204 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARF3P61204 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARF3P61204 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARF3P61204 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARF3P61204 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARF3P61204 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARF3P61204 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARF3P61204 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARF3P61204 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF3P61204 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF3P61204 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF3P61204 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF3P61204 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF3P61204 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF3P61204 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF3P61204 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF3P61204 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF3P61204 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF3P61204 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF3P61204 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF3P61204 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF3P61204 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF3P61204 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF3P61204 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF3P61204 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF3P61204 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF3P61204 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF3P61204 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF3P61204 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF3P61204 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF3P61204 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF3P61204 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARF3P61204 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF3P61204 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF3P61204 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF3P61204 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF3P61204 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF3P61204 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF3P61204 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF3P61204 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF3P61204 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF3P61204 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF3P61204 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF3P61204 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF3P61204 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF3P61204 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF3P61204 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF3P61204 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF3P61204 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF3P61204 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF3P61204 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF3P61204 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF3P61204 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF3P61204 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF3P61204 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF3P61204 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF3P61204 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARF3P61204 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms