Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVFRD-1P60508 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms