Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB38P57729 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB38P57729 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB38P57729 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB38P57729 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB38P57729 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB38P57729 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB38P57729 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB38P57729 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB38P57729 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB38P57729 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB38P57729 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB38P57729 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB38P57729 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB38P57729 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB38P57729 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB38P57729 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB38P57729 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB38P57729 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB38P57729 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB38P57729 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB38P57729 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB38P57729 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB38P57729 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB38P57729 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB38P57729 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB38P57729 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB38P57729 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB38P57729 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB38P57729 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB38P57729 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB38P57729 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB38P57729 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB38P57729 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB38P57729 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB38P57729 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB38P57729 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB38P57729 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB38P57729 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB38P57729 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB38P57729 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB38P57729 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB38P57729 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB38P57729 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB38P57729 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB38P57729 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB38P57729 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB38P57729 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB38P57729 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB38P57729 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB38P57729 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB38P57729 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB38P57729 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB38P57729 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB38P57729 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB38P57729 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB38P57729 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB38P57729 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB38P57729 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB38P57729 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB38P57729 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB38P57729 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB38P57729 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB38P57729 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB38P57729 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB38P57729 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB38P57729 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB38P57729 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB38P57729 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB38P57729 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB38P57729 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB38P57729 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB38P57729 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB38P57729 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB38P57729 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB38P57729 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB38P57729 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB38P57729 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB38P57729 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB38P57729 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB38P57729 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB38P57729 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB38P57729 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB38P57729 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB38P57729 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB38P57729 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB38P57729 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB38P57729 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB38P57729 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB38P57729 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB38P57729 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB38P57729 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB38P57729 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB38P57729 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB38P57729 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB38P57729 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB38P57729 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB38P57729 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB38P57729 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB38P57729 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms