Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TPD52P55327 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPD52P55327 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TPD52P55327 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPD52P55327 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPD52P55327 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPD52P55327 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TPD52P55327 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPD52P55327 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPD52P55327 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPD52P55327 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPD52P55327 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPD52P55327 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPD52P55327 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPD52P55327 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPD52P55327 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPD52P55327 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPD52P55327 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPD52P55327 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPD52P55327 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPD52P55327 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPD52P55327 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPD52P55327 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPD52P55327 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPD52P55327 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPD52P55327 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPD52P55327 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TPD52P55327 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPD52P55327 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPD52P55327 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPD52P55327 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPD52P55327 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPD52P55327 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPD52P55327 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPD52P55327 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPD52P55327 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPD52P55327 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPD52P55327 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPD52P55327 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPD52P55327 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPD52P55327 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TPD52P55327 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPD52P55327 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TPD52P55327 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TPD52P55327 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TPD52P55327 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TPD52P55327 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TPD52P55327 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPD52P55327 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPD52P55327 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPD52P55327 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPD52P55327 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPD52P55327 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPD52P55327 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPD52P55327 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPD52P55327 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms