Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP153P49790 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP153P49790 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP153P49790 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP153P49790 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP153P49790 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP153P49790 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP153P49790 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP153P49790 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP153P49790 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP153P49790 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP153P49790 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP153P49790 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP153P49790 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP153P49790 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP153P49790 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP153P49790 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP153P49790 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP153P49790 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP153P49790 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP153P49790 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP153P49790 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP153P49790 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP153P49790 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP153P49790 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP153P49790 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP153P49790 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP153P49790 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP153P49790 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP153P49790 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP153P49790 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP153P49790 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP153P49790 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP153P49790 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP153P49790 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP153P49790 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP153P49790 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP153P49790 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP153P49790 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP153P49790 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP153P49790 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP153P49790 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP153P49790 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP153P49790 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP153P49790 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP153P49790 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP153P49790 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP153P49790 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP153P49790 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP153P49790 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP153P49790 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP153P49790 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP153P49790 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP153P49790 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP153P49790 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP153P49790 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP153P49790 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP153P49790 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP153P49790 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP153P49790 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP153P49790 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
NUP153P49790 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
NUP153P49790 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP153P49790 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP153P49790 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP153P49790 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP153P49790 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP153P49790 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP153P49790 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP153P49790 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP153P49790 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP153P49790 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP153P49790 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP153P49790 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP153P49790 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP153P49790 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP153P49790 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NUP153P49790 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NUP153P49790 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP153P49790 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP153P49790 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NUP153P49790 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP153P49790 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NUP153P49790 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NUP153P49790 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NUP153P49790 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
NUP153P49790 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP153P49790 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NUP153P49790 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NUP153P49790 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NUP153P49790 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP153P49790 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NUP153P49790 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
NUP153P49790 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NUP153P49790 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP153P49790 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NUP153P49790 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NUP153P49790 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP153P49790 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP153P49790 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms