Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTBP49356 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTBP49356 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTBP49356 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTBP49356 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTBP49356 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTBP49356 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTBP49356 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTBP49356 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTBP49356 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTBP49356 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTBP49356 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTBP49356 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTBP49356 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTBP49356 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTBP49356 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTBP49356 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTBP49356 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTBP49356 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTBP49356 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTBP49356 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTBP49356 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTBP49356 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTBP49356 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTBP49356 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTBP49356 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTBP49356 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTBP49356 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTBP49356 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTBP49356 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTBP49356 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTBP49356 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTBP49356 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTBP49356 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTBP49356 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTBP49356 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTBP49356 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTBP49356 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTBP49356 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTBP49356 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTBP49356 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTBP49356 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTBP49356 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTBP49356 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTBP49356 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTBP49356 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTBP49356 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTBP49356 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTBP49356 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTBP49356 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTBP49356 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTBP49356 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTBP49356 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTBP49356 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTBP49356 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTBP49356 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTBP49356 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTBP49356 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTBP49356 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTBP49356 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FNTBP49356 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FNTBP49356 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FNTBP49356 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FNTBP49356 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FNTBP49356 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FNTBP49356 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FNTBP49356 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FNTBP49356 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FNTBP49356 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FNTBP49356 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FNTBP49356 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FNTBP49356 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FNTBP49356 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FNTBP49356 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FNTBP49356 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FNTBP49356 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FNTBP49356 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FNTBP49356 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FNTBP49356 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FNTBP49356 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FNTBP49356 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FNTBP49356 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FNTBP49356 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FNTBP49356 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FNTBP49356 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FNTBP49356 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FNTBP49356 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FNTBP49356 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FNTBP49356 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FNTBP49356 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FNTBP49356 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FNTBP49356 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FNTBP49356 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
FNTBP49356 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FNTBP49356 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FNTBP49356 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FNTBP49356 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FNTBP49356 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
FNTBP49356 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FNTBP49356 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms