Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIP4K2AP48426 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIP4K2AP48426 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms