Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms