Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AFMP43652 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AFMP43652 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AFMP43652 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AFMP43652 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
AFMP43652 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AFMP43652 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AFMP43652 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AFMP43652 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AFMP43652 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AFMP43652 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AFMP43652 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AFMP43652 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AFMP43652 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AFMP43652 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AFMP43652 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AFMP43652 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AFMP43652 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AFMP43652 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AFMP43652 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AFMP43652 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AFMP43652 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AFMP43652 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AFMP43652 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AFMP43652 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AFMP43652 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AFMP43652 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AFMP43652 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AFMP43652 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AFMP43652 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AFMP43652 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AFMP43652 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AFMP43652 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
AFMP43652 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AFMP43652 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AFMP43652 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AFMP43652 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AFMP43652 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AFMP43652 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AFMP43652 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AFMP43652 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AFMP43652 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AFMP43652 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AFMP43652 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AFMP43652 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AFMP43652 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AFMP43652 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AFMP43652 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AFMP43652 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AFMP43652 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AFMP43652 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AFMP43652 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AFMP43652 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AFMP43652 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AFMP43652 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AFMP43652 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AFMP43652 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AFMP43652 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AFMP43652 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AFMP43652 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AFMP43652 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AFMP43652 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AFMP43652 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AFMP43652 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AFMP43652 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AFMP43652 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
AFMP43652 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AFMP43652 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AFMP43652 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AFMP43652 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AFMP43652 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AFMP43652 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AFMP43652 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AFMP43652 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AFMP43652 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AFMP43652 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AFMP43652 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AFMP43652 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AFMP43652 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AFMP43652 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AFMP43652 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AFMP43652 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AFMP43652 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AFMP43652 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AFMP43652 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AFMP43652 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AFMP43652 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AFMP43652 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AFMP43652 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AFMP43652 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AFMP43652 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AFMP43652 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AFMP43652 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AFMP43652 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AFMP43652 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AFMP43652 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AFMP43652 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AFMP43652 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AFMP43652 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AFMP43652 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms