Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTGER3P43115 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms