Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZEB1P37275 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms