Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms