Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6P35125 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6P35125 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6P35125 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6P35125 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6P35125 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6P35125 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6P35125 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6P35125 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6P35125 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6P35125 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6P35125 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6P35125 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP6P35125 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6P35125 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6P35125 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6P35125 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6P35125 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6P35125 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6P35125 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6P35125 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6P35125 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6P35125 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6P35125 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6P35125 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6P35125 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6P35125 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6P35125 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6P35125 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6P35125 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6P35125 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6P35125 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6P35125 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6P35125 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP6P35125 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6P35125 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6P35125 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6P35125 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6P35125 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6P35125 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6P35125 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6P35125 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6P35125 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6P35125 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6P35125 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6P35125 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6P35125 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6P35125 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6P35125 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6P35125 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6P35125 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6P35125 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6P35125 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6P35125 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6P35125 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6P35125 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6P35125 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6P35125 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6P35125 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6P35125 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6P35125 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6P35125 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6P35125 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6P35125 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6P35125 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6P35125 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6P35125 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6P35125 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6P35125 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP6P35125 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6P35125 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6P35125 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6P35125 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6P35125 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6P35125 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6P35125 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6P35125 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6P35125 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6P35125 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6P35125 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6P35125 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6P35125 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6P35125 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6P35125 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6P35125 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6P35125 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6P35125 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6P35125 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6P35125 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6P35125 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6P35125 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6P35125 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6P35125 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6P35125 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6P35125 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6P35125 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6P35125 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6P35125 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6P35125 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP6P35125 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms