Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTX2P32243 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTX2P32243 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
OTX2P32243 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
OTX2P32243 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
OTX2P32243 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
OTX2P32243 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
OTX2P32243 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
OTX2P32243 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
OTX2P32243 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
OTX2P32243 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTX2P32243 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTX2P32243 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTX2P32243 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTX2P32243 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTX2P32243 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTX2P32243 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTX2P32243 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
OTX2P32243 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTX2P32243 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTX2P32243 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTX2P32243 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTX2P32243 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTX2P32243 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
OTX2P32243 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTX2P32243 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTX2P32243 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTX2P32243 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTX2P32243 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTX2P32243 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTX2P32243 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTX2P32243 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
OTX2P32243 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms