Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC12P31275 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms