Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNMT1P26358 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms