Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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