Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC9A1P19634 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms