Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRF1P14222 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRF1P14222 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRF1P14222 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRF1P14222 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRF1P14222 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRF1P14222 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRF1P14222 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRF1P14222 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRF1P14222 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRF1P14222 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRF1P14222 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRF1P14222 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRF1P14222 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRF1P14222 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRF1P14222 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRF1P14222 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRF1P14222 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRF1P14222 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRF1P14222 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRF1P14222 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRF1P14222 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRF1P14222 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRF1P14222 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRF1P14222 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRF1P14222 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRF1P14222 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRF1P14222 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRF1P14222 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRF1P14222 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRF1P14222 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRF1P14222 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRF1P14222 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRF1P14222 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRF1P14222 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRF1P14222 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRF1P14222 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRF1P14222 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRF1P14222 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRF1P14222 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRF1P14222 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRF1P14222 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRF1P14222 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRF1P14222 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRF1P14222 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRF1P14222 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRF1P14222 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRF1P14222 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRF1P14222 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms