Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms