Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.28
TOP2AP11388 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TOP2AP11388 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TOP2AP11388 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TOP2AP11388 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TOP2AP11388 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TOP2AP11388 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms