Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCF2P10911 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCF2P10911 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCF2P10911 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCF2P10911 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MCF2P10911 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCF2P10911 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCF2P10911 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCF2P10911 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCF2P10911 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2P10911 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2P10911 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2P10911 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2P10911 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2P10911 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2P10911 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2P10911 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2P10911 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2P10911 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2P10911 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2P10911 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2P10911 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2P10911 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2P10911 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2P10911 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2P10911 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2P10911 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2P10911 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2P10911 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2P10911 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2P10911 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2P10911 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2P10911 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2P10911 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2P10911 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2P10911 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2P10911 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2P10911 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2P10911 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2P10911 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2P10911 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2P10911 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2P10911 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2P10911 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2P10911 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2P10911 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2P10911 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2P10911 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2P10911 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2P10911 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2P10911 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2P10911 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2P10911 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2P10911 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2P10911 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2P10911 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2P10911 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2P10911 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2P10911 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2P10911 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2P10911 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2P10911 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2P10911 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2P10911 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2P10911 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2P10911 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2P10911 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2P10911 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2P10911 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2P10911 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2P10911 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2P10911 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2P10911 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2P10911 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2P10911 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2P10911 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2P10911 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2P10911 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2P10911 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCF2P10911 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCF2P10911 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCF2P10911 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCF2P10911 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCF2P10911 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCF2P10911 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCF2P10911 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCF2P10911 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCF2P10911 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MCF2P10911 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCF2P10911 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCF2P10911 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCF2P10911 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCF2P10911 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCF2P10911 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCF2P10911 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCF2P10911 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MCF2P10911 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MCF2P10911 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCF2P10911 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCF2P10911 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms