Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms