Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD2P0DJD1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGPD2P0DJD1 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms