Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00032P0C843 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms