Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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