Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI1P08151 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI1P08151 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI1P08151 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI1P08151 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI1P08151 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI1P08151 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI1P08151 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI1P08151 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI1P08151 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI1P08151 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI1P08151 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI1P08151 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI1P08151 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI1P08151 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI1P08151 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI1P08151 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI1P08151 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI1P08151 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI1P08151 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI1P08151 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI1P08151 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI1P08151 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI1P08151 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI1P08151 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI1P08151 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI1P08151 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI1P08151 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI1P08151 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI1P08151 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI1P08151 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI1P08151 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI1P08151 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI1P08151 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI1P08151 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI1P08151 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI1P08151 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI1P08151 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI1P08151 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI1P08151 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI1P08151 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GLI1P08151 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GLI1P08151 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GLI1P08151 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GLI1P08151 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GLI1P08151 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GLI1P08151 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GLI1P08151 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GLI1P08151 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GLI1P08151 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GLI1P08151 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GLI1P08151 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GLI1P08151 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GLI1P08151 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GLI1P08151 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GLI1P08151 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms